DNR genotipavimo paslaugos miško medžiams/DNA genotyping services for forest trees (Supaprastintas atviras konkursas)

DNR genotipavimo paslaugos. Paslaugos teikėjas turi atlikti: a) DNR išskyrimą iš mažo kiekio Quercus robur ir Picea abies audinių, siekiant gauti DNR koncentraciją ir grynumą, atitinkančius SNP genotipavimo reikalavimus; b) Quercus robur atrinkti 400-500 SNP lokusų rinkinį ir Picea abiesatrinkti 4000-5000 SNP lokusų rinkinį taip, kad šie lokusai apytikriai vienodomis proporcijomis atspindėtų neutralią ir funkcinę DNR; c) SNP genotipavimą, naudojant tikslinį genotipavimo pagal DNR sekoskaitą (ang. Targeted Genotyping by Sequencing, sutrumpinus T-GBS) metodą, paremtą Flex-Seq ar lygiaverte T-GBS technologija./SNP Genotyping requirements. The contractor shall perform (a) DNA extraction from small amounts tissues of Quercus robur and Picea abies to obtain DNA concentration and purity satisfying requiremetns for SNP gentyping, (b) for Quercus robur selection of a set 400-500 SNP loci and for Picea abies selection of a set of 4000-5000 SNP loci, in such way that for each species, these loci represent neutral and functional DNA at nearly equal proprtions. (c) SNP genotyping using a targeted genotyping-by-sequencing (T-GBS) approach, based on Flex-Seq or other adequite T-GBS method.